辣椒漚根是一種生理性病害。早春苗床發生較重，尤以育苗技術粗放、氣候不良的地方極易發生。

1.癥狀。發生漚根的幼苗，長時間不發新根，不定根少或完全沒有，原有根皮發黃呈銹褐色，逐漸腐爛。漚根初期，幼苗葉片變薄，陽光照射后白天萎蔫，葉緣焦枯，逐漸整株枯死，病苗極易從土中拔起。
2.發生條件。漚根多發生在幼苗發育前期。辣椒苗漚根的主要原因是苗床土壤濕度過高，或遇連陰雨雪天氣，床溫長時間低于12℃，光照不足，土壤過濕缺氧，妨礙根系正常發育，甚至超越根系耐受限度，使根系逐漸變褐死亡。
3.防治方法。防治漚根應從育苗管理抓起，宜選地勢高、排水良好、背風向陽的地段作苗床地，床土需增施有機肥兼配磷鉀肥。出苗后注意天氣變化，做好通風換氣，可撒干細土或草木灰降低床內濕度，同時認真做好保溫，可用雙層塑料薄膜覆蓋，夜間可加蓋草簾。條件許可，可采用地熱線、營養盤、營養缽、營養方等方式培育壯苗。